洗脱不充分有时候我们裂解结合液各种条件优化到了了，可是核酸得率仍然很低。这种情况有可能是磁珠结合了核酸，但是由于洗脱不充分，磁珠价格，磁珠结合的核酸没有被洗脱下来。首先，电感磁珠，磁珠在晾干过程中可能干燥过度，导致核酸干结在磁珠上不能洗脱下来；第二，洗脱液体积过小导致无法充分洗脱。晾干过程中，需要观察磁珠处于稍微湿润的状态即可，不能完全干燥，这样核酸更容易溶解于洗脱液中。洗脱体积不能太少也不能太多，太少磁珠上的核酸很难洗脱充分，莆田磁珠，太多会导致浓度偏低。一般来说 0.5mg 的磁珠，洗脱液的体积为 70-100ul。
氧化铁纳米颗粒(IONPs)是一种惰性化学材料，主要用于成像和载面。但是，氧化铁纳米颗粒本身是否可以作为，还没有相关研究。这篇文章分别在动物、细胞、分子水平研究了Fe2O3纳米颗粒均可以保护心脏免受缺血性损伤。Fe2O3纳米颗粒的护心活性需要纳米颗粒的完整性，而不取决于颗粒表面的电荷或者偶联上的分子。此外，Fe2O3纳米颗粒对正常的心肌细胞没有明显的毒性，说明了其疾病的潜力。
结合缓冲液一般采用醇类结合，比如乙醇，有些厂家缓冲液是直接使用柱法的试剂转换成磁珠法的，会发现在柱法中表现很好的试剂，在磁珠法中得率很低。这是因为柱法不但其硅胶柱具备结合核酸的能力，贴片磁珠，还有类似「分子筛」的效果。而磁珠法一般是通过静电吸附、疏水作用来结合核酸，所以对于结合液的结合能力要求会更高，一般可以通过提高醇的比例来增强结合能力，同时，也要提高离液盐（胍盐、钠盐等）的浓度来促进核酸与磁珠的结合。
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